冬虫夏草保存环境的温度不能高，在常温和高温环境下，冬虫夏草有效成分的分解速度会大大加快，少量冬虫夏草可全部放入冰箱冷藏层（保鲜层）保存，冷藏温度以2～5度为宜，如冬虫夏草的数量较多（100克以上），巍珍源冬虫夏草（虫草产地直销网）掌柜建议大家可以这样做：则应分成两份，一份数量较少（30～50克即可）放入冰箱冷藏层保存，以备冬虫夏草在每次服用时由冷藏层中取出，余下为数量较多的一分则放入冰箱冷冻层（又称深冻层或速冻层，不是变温层）保存。

冬虫夏草保存期间不能受潮，如果吸收了一定量的水蒸气，会使有效成分的流失速度加快，药效明显降低，因此冬虫夏草在保存时要密封严实。

冬虫夏草在保存期间，要尽量减少开启的次数，因为冷藏或冷冻的冬虫夏草在开启后会与外界空气接触，温度会迅速上升，频繁开启会使冬虫夏草与外界空气频繁接触，温度频繁变化，也容易吸收空气中的水蒸气，不利于维持冬虫夏草有效成分的稳定；如果要每日开启服用，的办法是从全部冬虫夏草中分出少量作为另一份存放于冷藏中，以备每次服用时随时取出，当随用随取的这份用完了，再照此法分出少量冷藏保存。